刘小敏,南方科技大学公共卫生及应急管理学院副教授,研究员,博士生导师,深圳市盐田区“梧桐凤凰”人才,深圳市人体共生微生物和健康研究重点实验室副主任,南方科技大学&深圳华大基因学院&武汉理工大学等研究生导师和高级讲师。
目前研究方向为包括人基因组,宏基因组和代谢组在内的疾病多组学研究。主要研究内容是通过对基因组、代谢组和微生物组等多个层面的组学数据进行分析和整合,探索宿主基因组和各部位菌群以及代谢物的关联机制和因果关系,以及重大疾病发生发展的分子机理。建立了基因组,宏基因组,代谢组等多组学分析平台;探讨多组学与代谢性疾病及复杂疾病的关联机制;首次创新性运用孟德尔随机化这一天然过程发现了多项可能具有应用前景的肠道菌群与宿主代谢表型的因果作用,例如Alistipes和Oscillibacter有望降低甘油三酯,肠道菌群果糖代谢通路升高尿酸、降低孕酮,而血液的叶酸、硒等水平通过抑制变形菌门从而降低心血管疾病发生风险。这些研究为靶向菌群的代谢性疾病干预治疗提供数据支持和重要参考。
目前已发表SCI文章26篇,其中以第一或通讯(含共同)作者发表文章14篇,包括2篇Nature Genetics,2篇 Cell Discovery杂志一作文章。已申请发明专利6项,授权3项。主持国家自然科学青年基金一项,作为课题骨干参与多项国家级基金、深圳市科学创新委员会等科技项目。
宿主—微生物互作;
基因组、宏基因组等多组学技术在疾病发生发展中应用研究
2007.09-2011.06天津师范大学计算机科学与技术&教师教育双修,获学士学位
2016.03-2018.12 华南理工大学生物工程专业,获硕士学位
2020.09-2023.06 中国科学院大学基因组学专业,获博士学位
2011.07-2016.02 深圳华大生命科学研究院,助理研究员
2019.01-2020.08 深圳华大生命科学研究院,助理研究员
2023.07-2025.11 深圳华大生命科学研究院,副研究员
2025.12-至今 南方科技大学副教授
1) Zou L #, Zhang Z#, .. , Zhang T*, Liu X*. Unraveling the impact of host genetics and factors on the urinary microbiome. mBio. 2024; DOI: doi:10.1128/mbio.02773-24
(IF: 5.9,中科院SCI一区,最后通讯作者)
2) Liu X#, Tong X#, Zou L#, et al. A genome-wide association study reveals the relationship between human genetic variation and the nasal microbiome. Communications Biology. 2024; 7(1): 139. (IF: 6.548,中科院SCI一区,第一作者)
3) Liu X #, Tong X #, Jie Z #, Zhu J, Tian L, Sun Q, Ju Y, Zou L, Lu H, Qiu X, ..,et al. Sex differences in the oral microbiome, host traits, and their causal relationships. iScience. 2023;26(1):105839. (IF:6.11,第一作者)
4) Liu X #, Zou L #, Nie C #, Qin Y, Tong X, Wang J, Yang H, Xu X, Jin X, Xiao L, ..,e,t al. Mendelian randomization analyses reveal causal relationships between the human microbiome and longevity. Scientific Reports. 2023;13: 5127 (IF: 4.90,第一作者)
5) Liu X #, Tong X #, Zou Y, Lin X, Zhao H, Tian L, Jie Z, Wang Q, Zhang Z, Lu H, ..,et al. Mendelian randomization analyses support causal relationships between blood metabolites and the gut microbiome. Nature Genetics. 2022;54(1):52-61. (IF:41.307,中科院SCI一区,第一作者)
6) Liu X#, Tang S, Zhong H, Tong X, Jie Z, Ding Q, Wang D, Guo R, Xiao L, Xu X, ..,et al. A genome-wide association study for gut metagenome in Chinese adults illuminates complex diseases. Cell Discovery. 2021;7(1):9. (IF: 38.079,中科院SCI一区,第一作者)
7) Liu X#, Tong X, Zhu J, Tian L, Jie Z, Zou Y, Lin X, Liang H, Li W, Ju Y, ..,et al. Metagenome-genome-wide association studies reveal human genetic impact on the oral microbiome. Cell Discovery. 2021;7(1):117. (IF: 38.079,中科院SCI一区,第一作者)
8) Liu X #, Song Z #, Li Y #, Yao Y #, Fang M, Bai C, An P, Chen H, Chen Z, Tang B, ..,et al. Integrated genetic analyses revealed novel human longevity loci and reduced risks of multiple diseases in a cohort study of 15,651 Chinese individuals. Aging Cell. 2021; 20(10):13323 (IF: 9.32,中科院SCI一区,第一作者)
9) Liu X #, Xu H #, Xu H #, Geng Q, Mak W, Ling F, Su Z, Yang F, Zhang T, Chen J, ..,et al. New genetic variants associated with major adverse cardiovascular events in patients with acute coronary syndromes and treated with clopidogrel and aspirin. The Pharmacogenomics Journal 2021; 21, 664–672 (IF: 3.245,第一作者)
10) Zeng Y #, Chen H#, Liu X #, Song Z #, Yao Y#, .., et al. Genetic associations with longevity are on average stronger in females than in males. Heliyon. 2024. (IF: 3.4, 并列第一作者)
11) Zeng Y #, Nie C #, Min J #, Chen H #, Liu X #, Ye R, Chen Z, Bai C, Xie E, Yin Z, ..,et al. Sex Differences in Genetic Associations With Longevity. JAMA Network Open. 2018 (IF: 8.483,中科院SCI一区,并列第一作者)
12) Zhao X, Liu X#, Zhang A, Chen H, Huo Q, Li W, Ye R, Chen Z, Liang L, Liu QA,.., et al. The correlation of copy number variations with longevity in a genome-wide association study of Han Chinese. Aging. 2018 (IF: 5.179,并列第一作者)
13) Zhou F#,Cao H#,Zuo X#, Zhang T#, Zhang X#, Liu X #, Xu R, Chen G, Zhang Y, Zheng X, .., et al. Deep sequencing of the MHC region in the Chinese population contributes to studies of complex disease. Nature Genetics. 2016. (IF: 27.125,中科院SCI一区,并列第一作者)
14) Zeng Y #, Nie C #, Min J #, Liu X#, Li M, Chen H, Xu H, Wang M, Ni T,.., et al. Novel loci and pathways significantly associated with longevity. Scientific Reports. 2016 (IF: 4.122,并列第一作者)
近年科研项目:
1)国自然青年基金“基于全基因组测序数据探索宿主结构变异对人体肠道菌群的影响”
2) 国家重点研发计划课题 “基于临床研究的肥胖症中医病机理论和治法现代诠释”
3) 深圳市基础研究专项(自然科学基金)基础研究重点项目 ”基20240038人体微生物与宿主互作的分子图谱研究及应用”
4) 国家重点研发计划青年科学家项目“基于人群队列的多血管床动脉粥样硬化无创检测指标及其示范应用研究”
5)国家重点研发计划课题 “罕见病多模态辅助诊疗平台建立及临床转化应用”
6)国家重点研发计划课题 “慢阻肺易感基因及生物标志物筛查研究”